bioinfo@ird.fr

Trainings- HPC

Initiation à l’utilisation du cluster i-Trop


Ce cours est une introduction à l’utilisation du cluster i-Trop. Il s’adresse aux nouveaux utilisateurs avec le but d’améliorer leur autonomie dans le lancement de leurs analyses. Les notions de Module environment, utilisation en mode intéractif, lancement de jobs en mode batch seront développées.

Pré-requis

Bases sous Linux

Programme

  • Introduction aux architectures de cluster
  • Découvrir l’utilisation de Slurm
  • Gestion des données sur le cluster
  • Utilisation en mode interactif
  • Lancement de jobs en mode batch

Objectifs

Après ce cours, les participants seront capables de:
  • Utiliser les ressources du cluster en mode intéractif
  • Gérer les copies de données sur le cluster
  • Utiliser les Modules Environment
  • Lancer un job simple en mode batch

Support de cours

Formateurs

  • Ndomassi Tando (NT) – ndomassi.tando@ird.fr
  • Bertrand Pitollat(BP) – bertrand.pitollat@cirad.fr
  • Alexis Dereeper (AD) – alexis.dereeper@ird.fr
  • Francois Sabot (SB) – francois.sabot@ird.fr
  • Bruno Granouillac (BG) – bruno.granouillac@ird.fr
  • Pierre Larmande (PL) – pierre.larmande@ird.fr
  • Christine Tranchant (CT) – christine.tranchant@ird.fr
  • Valérie Noel (VN) – valerie.noel@ird.fr
  • Julie Orjuela (JO) – julie.orjela@ird.fr
  • Aurore Comte (AC) – aurore.comte@ird.fr
  • Gaetan Droc (GD) – gaetan.droc@cirad.fr

Formations

Date Location Topics Participants Instructors Links Units
Juil 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 2 NT UMR DIADE
Mai 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT UMR DIADE
Avr 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Avr 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 1 JO UMR DIADE
Mar 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Mar 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Fev 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Jan 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 2 NT UMR DIADE
Jan 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Jan 2021 IRD Montpellier, France HPC Introduction 6 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Dec 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 2 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Dec 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Nov 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 2 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Sept 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Juil 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 7 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Juin 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Mai 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Mai 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
Avril 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT UMR DIADE
Avril 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 1 NT UMR DIADE
Avril 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 1 NT UMR DIADE
Mars 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 8 NT,VN UMR DIADE,,MIVEGEC
Mars 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT UMR DIADE
Fev 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 9 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
Fev 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
Jan 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 10 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
Jan 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 17 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
Jan 2020 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT UMR DIADE
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 1 NT UMR DIADE
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 1 NT UMR DIADE
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 8 NT,JO,AC UMR DIADE,BOREA,IPME
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 12 NT,VN,CT UMR DIADE,MIVEGEC, DIADE
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 8 BT,GD,NT UMR AGAP,AGAP, DIADE
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 7 NT,VN UMR DIADE,MIVEGEC
2019 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT,VN UMR DIADE, MIVEGEC
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 3 NT UMR DIADE
2018 IRD Thiès, Senegal HPC Introduction 20 NT, CT UMR DIADE, DIADE
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 5 NT UMR DIADE
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 6 NT UMR DIADE
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 15 NT, AD, BP UMR DIADE, IPME, AGAP
2018 IRD Montpellier, France HPC Introduction 4 NT UMR DIADE
2017 IRD Montpellier, France HPC Introduction 8 NT UMR DIADE
2017 IRD Montpellier, France HPC Introduction 7 NT UMR DIADE
2017 IRD Montpellier, France HPC Introduction 7 NT UMR DIADE
2017 IRD Dakar, Senegal HPC Introduction 15 NT, SB UMR DIADE, DIADE
2016 IRD Montpellier, France HPC Introduction 12 NT UMR DIADE
2015 IRD Montpellier, France HPC Introduction 11 NT UMR DIADE
2014 IRD Montpellier, France HPC Introduction 27 NT,AD,PL,BG,CT UMR DIADE, IPME, DIADE, TransVIHMI, DIADE